核心前提：用户询问的是在股权代持案件经过法院判决后，税务局将如何处理相关税务事宜。

核心结论：

1. 税务处理依据法院判决：

   • 税务局在处理股权代持案件的税务事宜时，会依据法院的判决结果。如果法院判决确认了股权的实际归属，税务局将根据判决结果来认定纳税义务人，并据此进行税务处理。

2. 纳税义务人的确定：

   • 在股权代持关系中，名义股东和实际股东可能存在不同的税务责任。法院判决后，税务局会根据判决结果明确纳税义务人。如果判决确认实际股东为股权所有者，那么实际股东将承担相应的纳税义务；如果名义股东被认定为纳税义务人，税务局也将依法进行追缴。

3. 税务申报与缴纳：

   • 纳税义务人需根据税务局的要求，进行税务申报并缴纳相应税款。这包括但不限于个人所得税、企业所得税等，具体税种和税率将根据股权转让的性质、金额以及相关法律法规来确定。

4. 税务稽查与风险：

   • 税务局有权对股权代持案件进行税务稽查，以确保纳税义务人依法履行纳税义务。如果发现纳税义务人存在偷税、漏税等违法行为，税务局将依法进行处罚，并可能追究相关人员的法律责任。

5. 建议与咨询：

   • 对于涉及股权代持的税务问题，建议纳税义务人及时咨询专业税务律师或会计师，以确保依法合规处理税务事宜。如有任何疑问或需要进一步的法律咨询，可以直接向我提问，我将根据您的具体情况提供详细的解答和建议。

综上所述，税务局在处理股权代持案件的税务事宜时，会依据法院的判决结果来认定纳税义务人，并据此进行税务处理。纳税义务人需依法履行纳税义务，如有任何疑问或需要进一步的法律咨询，请随时向我提问。