关于劳动能力鉴定是由公司申请还是个人申请的问题，实际上，劳动能力鉴定的申请主体并不单一，它可以是用人单位、工伤职工本人，或者是工伤职工的近亲属。下面我将为您详细解释：
用人单位：
- 当职工发生工伤，并且经过治疗伤情相对稳定后，如果存在残疾或影响劳动能力的情况，用人单位有责任及时向设区的市级劳动能力鉴定委员会提出劳动能力鉴定申请。
- 这是因为用人单位与职工存在劳动关系，对职工的工伤情况有一定了解，且其有责任保障职工的权益并处理工伤相关事宜。
工伤职工或其近亲属：
- 如果用人单位未按规定时间提出申请，工伤职工或其近亲属有权在有效时间内自行向同一机构提出鉴定申请，以保障自身权益。
- 工伤职工本人直接申请，能更好地维护自身权益，表达自身诉求。而近亲属在职工因各种原因无法亲自申请时，可代为申请。
工会组织（虽然您未直接提及，但这也是一个重要的申请主体）：
- 工会作为维护职工权益的组织，在职工工伤后，为确保职工获得应有的劳动能力鉴定和相应待遇，也有权向劳动能力鉴定委员会提出申请。
申请所需材料通常包括：
- 劳动能力鉴定申请表（需填写完整、准确，个人申请时可省略加盖用人单位公章）。
- 工伤认定决定书原件及复印件。
- 有效的诊断证明、按医疗机构规定复印的检查报告等完整病历资料。
- 工伤职工的居民身份证或社会保障卡等有效身份证明原件及复印件。
- 根据劳动能力鉴定委员会的具体要求，可能还需提供的其他相关材料。
申请流程大致为：
- 提交申请及相关材料至设区的市级劳动能力鉴定委员会。
- 委员会对材料进行审核，如不完整将告知需补正的内容。
- 材料齐全后，委员会组织专家进行鉴定。
- 基于专家意见，委员会作出劳动能力鉴定结论。
- 鉴定结论作出后，将及时送达给申请鉴定的单位和个人。
综上所述，劳动能力鉴定的申请主体可以是用人单位、工伤职工本人或其近亲属，具体选择哪个主体申请，需根据实际情况和法律规定来决定。希望这个解答能对您有所帮助。