当公司破产清算且拖欠员工工资时，员工可以通过以下步骤来维护自己的合法权益：
一、确认债权并申报
收集证据：员工首先需要收集能证明劳动关系和工资数额的证据，如劳动合同、工资条、考勤记录等。这些证据在后续的债权申报和维权过程中将起到至关重要的作用。
申报债权：在得知公司破产清算的消息后，员工应在破产管理人通知的期限内（通常不少于30日且不超过3个月）向破产管理人申报工资债权。申报时，需详细说明自己被拖欠的工资数额及其他相关权益。
二、参与破产程序
参加债权人会议：员工作为债权人，有权参加债权人会议。在会议上，员工可以了解公司破产清算的进展情况，表达自己的诉求，并行使表决权等相关权利，以监督破产程序的进行。
监督破产过程：员工可以监督破产管理人对公司财产的清理、评估、变价等工作，确保资产得到合理处置，防止流失，从而保障有足够的财产用于清偿工资等债务。
三、寻求法律途径维权
提起劳动仲裁：如果公司未能在破产清算过程中及时支付拖欠的工资，员工可以先向劳动仲裁机构提起仲裁，要求公司支付工资。仲裁裁决生效后，如公司仍未支付，员工可凭裁决书参与到破产清算的工资分配程序中。
提起法律诉讼：若劳动仲裁无法解决问题，员工可以向法院提起诉讼，要求公司支付工资。法院会依法对工资债权进行判定和处理，确保员工的合法权益得到保障。
四、关注破产进展并配合调查
关注破产程序进展：员工应密切关注公司破产清算的进程，以便及时了解自己的工资债权是否得到清偿，并适时采取必要的维权措施。
配合调查与提供信息：在整个破产清算过程中，员工要积极配合破产管理人的调查工作，如实提供所需的信息和资料，以确保破产程序的顺利进行。
五、注意事项
保留相关证据：在整个维权过程中，员工应妥善保管与工资相关的所有证据材料，以备不时之需。
合法维权：员工在维护自己权益的过程中，应始终遵守法律法规，通过合法途径来解决问题。避免采取过激行为或非法手段，以免对自身造成不必要的损失。
了解清偿顺序：根据《企业破产法》，破产财产在优先清偿破产费用和共益债务后，应首先清偿所欠职工的工资、医疗、伤残补助、抚恤费用等。这意味着员工工资在破产清算中具有优先受偿的地位。但如果公司资产不足以清偿全部债务，将按照比例进行清偿。
综上所述，当公司破产清算并拖欠员工工资时，员工应充分了解并参与破产清算程序，及时申报债权；同时，可通过提起劳动仲裁或诉讼、向劳动监察部门投诉（虽然此步骤在直接办理手续中未明确提及，但也是维权的重要途径之一）、寻求工会帮助等途径来维护自己的合法权益。在整个过程中，员工应密切关注破产进展、保留相关证据并合法维权。