关于在办理贪污、受贿等经济犯罪案件中正确运用免予起诉的几点意见，以下是我的详细解答：

1. 免予起诉的适用条件：

   • 免予起诉，在现行刑事诉讼制度中，已更改为“不起诉”决定中的一种情形，即“酌定不起诉”。在贪污、受贿等经济犯罪案件中，若犯罪嫌疑人犯罪情节轻微，依照刑法规定不需要判处刑罚或者免除刑罚的，人民检察院可以作出不起诉决定。
   • 具体适用时，需综合考虑犯罪嫌疑人的犯罪动机、手段、后果、悔罪表现以及社会危害性等因素。例如，若犯罪嫌疑人系初犯、偶犯，且主动退缴赃款赃物，有悔罪表现，社会危害性不大，则可考虑适用酌定不起诉。

2. 免予起诉（酌定不起诉）的法律效果：

   • 作出不起诉决定后，犯罪嫌疑人将不被提起公诉，从而避免了刑事审判程序。
   • 但不起诉决定并不意味着犯罪嫌疑人无罪，而是基于其犯罪情节轻微，依法不需要判处刑罚或免除刑罚。因此，不起诉决定具有一定的法律约束力，犯罪嫌疑人需遵守相关法律规定，不得再犯。

3. 办理贪污、受贿等经济犯罪案件时运用免予起诉的注意事项：

   • 严格审查证据：在决定是否适用不起诉时，必须严格审查案件证据，确保事实清楚、证据确实充分。
   • 充分听取意见：在作出不起诉决定前，应充分听取犯罪嫌疑人、被害人及其诉讼代理人的意见，确保决定的公正性和合理性。
   • 注重社会效果：在办理贪污、受贿等经济犯罪案件时，除考虑法律效果外，还应注重社会效果，确保不起诉决定能够得到社会各界的认可和理解。

4. 免予起诉（酌定不起诉）与相关制度的衔接：

   • 若犯罪嫌疑人被作出不起诉决定后，又发现新的犯罪事实或者证据，人民检察院可依法撤销不起诉决定，提起公诉。
   • 同时，不起诉决定并不影响被害人的自诉权利。若被害人认为不起诉决定有误，可依法向上一级人民检察院申诉，或直接向人民法院提起自诉。

综上所述，在办理贪污、受贿等经济犯罪案件中正确运用免予起诉（酌定不起诉）制度，需综合考虑犯罪嫌疑人的犯罪情节、悔罪表现以及社会危害性等因素，并严格遵守相关法律规定和程序要求。如有任何疑问或需要进一步的法律咨询，请直接向我提问。