当公司注册地和住所地不一致时，关于管辖的规定主要依据《中华人民共和国民事诉讼法》及其相关司法解释来确定。以下是对这一问题的详细解答：
一、基本原则
根据《最高人民法院关于适用<中华人民共和国民事诉讼法>的解释》，法人或者其他组织的住所地是指其主要办事机构所在地。如果法人或其他组织的主要办事机构所在地不能确定，则以其注册地或登记地为住所地。这意味着，在确定管辖法院时，会优先考虑公司的主要办事机构所在地，如果这一地点无法确定，才会回退到注册地或登记地。
二、注册地与主要办事机构所在地不一致时的处理
举证责任：
- 当公司的注册地与主要办事机构所在地不一致时，主张以公司的主要办事机构所在地为管辖连接点的当事人，需要提供其主要办事机构所在地位于受诉法院辖区的证据材料。这些证据可能包括房屋租赁合同、物业公司开具的证明、主要办事机构现场照片等。
法院审查：
- 法院在审查管辖权异议时，会综合考虑当事人提供的证据，判断公司的主要办事机构所在地是否确实位于受诉法院辖区。如果证据充分，法院会认定以主要办事机构所在地为管辖连接点；如果证据不足或无法确定，法院则会以注册地或登记地为管辖连接点。
三、合同中约定管辖的情况
约定由公司住所地法院管辖：
- 如果合同中约定由一方公司住所地法院管辖，且该公司在协议签订后住所地发生变更，根据《最高人民法院关于适用<中华人民共和国民事诉讼法>的解释》第三十二条的规定，应由签订管辖协议时的住所地人民法院管辖，但当事人另有约定的除外。这意味着，即便公司住所地变更，也应以签订合同时该公司的注册地或登记地作为住所地确定管辖。
合同中载明非注册登记地的公司地址：
- 如果合同中约定由一方的公司或其他组织住所地（所在地）法院管辖，并载明了非注册登记地的该公司或其他组织的地址，在合同中无相斥意思表示、各方在签订合同时均未提出异议的情况下，可以推定该地址是该公司签订合同时的主要办事机构所在地，进而成为确定管辖的连接点。然而，如果被告提出异议并提供了相反证据，法院将根据实际情况进行判断。
四、实际操作建议
公司应及时办理变更登记：
- 当公司的主要办事机构所在地发生变更时，应及时向登记机关申请变更登记，以避免因信息不一致而引发的管辖权争议。
在合同中明确管辖条款：
- 在签订合同时，双方应明确约定管辖法院，并尽可能详细地载明公司的住所地信息，以减少后续可能出现的管辖权争议。
积极应对管辖权异议：
- 当面临管辖权异议时，公司应积极收集并提供相关证据材料，以支持自己的主张。同时，也应尊重法院的审查结果，并按照法院的裁定进行后续诉讼活动。
综上所述，当公司注册地和住所地不一致时，关于管辖的规定主要依据公司的实际经营情况和合同中的约定来确定。在处理相关争议时，应充分考虑证据的充分性和法律的规定，以确保诉讼活动的顺利进行。