在承包工程合同中，若要明确工人工资不由发包方支付，应在合同中清晰约定承包方负责支付工人工资的相关条款。以下是具体分析：

一. 明确支付责任

1. 条款内容：在合同中应明确约定，工人工资及与工人相关的所有费用均由承包方承担，与发包方无关。例如，可以写入“承包方负责支付所有工人的工资及相关的社会保险费用，发包方不承担任何与工人工资相关的支付责任。”
2. 法律依据：《中华人民共和国合同法》第十二条规定，合同的内容由当事人约定，一般包括价款或者报酬等条款。在此，报酬即包括工人工资，因此合同中应明确约定工人工资的支付方。

二. 细化支付细节

1. 支付方式：可以进一步约定承包方支付工人工资的具体方式，如银行转账、现金支付等，并明确支付的时间节点，如每月的固定日期或工程进度的某个阶段。
2. 避免混淆：在合同中应明确区分发包方支付的工程款项与承包方支付的工人工资，避免两者混淆。可以约定发包方支付的工程款项仅用于工程材料、设备采购及承包方的管理费用，不包括工人工资。

三. 法律风险提示

1. 合规性：虽然合同中约定工人工资不由发包方支付，但承包方仍需确保按时足额支付工人工资，以避免触犯劳动法等相关法律法规。
2. 证据留存：承包方应妥善保存支付工人工资的凭证，如银行转账记录、工人签收的工资单等，以备将来可能出现的纠纷。

我建议在撰写此类条款时，应确保内容清晰、明确，无歧义，以避免未来可能出现的法律纠纷。同时，承包方也应严格遵守合同约定，确保工人工资的按时足额支付。如有进一步需要，您可以继续咨询我。