您好，如果您与配偶已经三年不同居，并希望起诉离婚，以下是一些详细的步骤和建议供您参考：

一、明确法律依据

首先，需要明确的是，法律并未规定夫妻必须分居达到一定年限才能起诉离婚。只要夫妻感情破裂或存在其他法定离婚事由，如重婚、家庭暴力、虐待、遗弃、赌博、吸毒等恶习屡教不改等，任何一方都有权向有管辖权的人民法院提起离婚诉讼。

同时，《中华人民共和国民法典》第一千零七十九条提到，夫妻因感情不和分居满两年，且调解无效的，应当准予离婚。这一条款可以作为您起诉离婚的一个法律依据，但并非必要条件。

二、撰写起诉状

在决定起诉离婚后，您需要撰写一份起诉状。起诉状应包含以下内容：

1. 双方基本信息：包括您和配偶的姓名、性别、年龄、民族、职业、工作单位、住所等。
2. 诉讼请求：明确阐述您的诉讼请求，即请求法院判决离婚。
3. 事实与理由：详细说明您与配偶三年不同居的情况，以及夫妻感情破裂的具体事实和理由。可以提及分居的起始时间、分居状态、分居原因（如感情不和）等，并强调双方已经无法继续共同生活。

三、准备证据材料

为了支持您的起诉状，您需要准备充分的证据材料来证明分居事实和分居时间，以及夫妻感情破裂的情况。这些证据可能包括：

1. 分居协议：如果双方曾签订过分居协议，可以作为证明分居事实和时间的直接证据。
2. 租房合同：如果您或配偶在分居期间单独租房居住，租房合同可以作为证明分居状态的证据。
3. 证人证言：亲朋好友或邻居的证言，证明您与配偶已经长时间分居，且双方关系疏远。
4. 其他证据：如通讯记录、社交媒体动态等，可以间接证明双方已经长时间没有共同生活。

四、向法院递交起诉状及证据

在撰写完起诉状并准备好证据材料后，您需要向有管辖权的法院递交起诉状及证据。一般来说，离婚诉讼应由被告住所地人民法院管辖。如果被告住所地与经常居住地不一致的，由经常居住地人民法院管辖。

五、参与庭审过程

法院受理您的起诉后，会安排开庭审理。在庭审过程中，您需要围绕是否感情破裂、分居事实等进行陈述和辩论。法院会根据您提供的证据和双方的陈述，对案件进行审理，并作出判决。

六、注意事项

在整个起诉离婚过程中，您需要注意以下几点：

1. 遵循法律程序：严格遵循民事诉讼法等相关法律规定的程序和要求，以确保自身合法权益得到妥善维护。
2. 保持冷静理智：虽然离婚是一件令人痛苦的事情，但请尽量保持冷静理智，避免情绪化的行为影响案件的审理。
3. 寻求专业帮助：如果您对法律程序不熟悉或感到困惑，可以寻求专业律师的帮助，以更好地维护自己的合法权益。

希望以上建议能对您有所帮助。如果您有任何其他问题或需要进一步的帮助，请随时咨询。