小偷偷了电动自行车发票3600元，是否会判刑，取决于具体的法律事实和法律规定。以下是对此问题的详细分析：
发票本身的价值与偷窃行为的定性：
- 发票是记录交易行为的凭证，其本身并不具有直接的货币价值。因此，偷窃发票的行为，并不直接等同于偷窃了与发票金额相等的财物。
- 在此情况下，发票上标注的3600元是交易金额，而非发票本身的价值。
偷窃行为的法律后果：
- 根据我国刑法，偷窃行为可能构成盗窃罪。但是，构成盗窃罪需要满足一定的条件，包括偷窃的财物达到一定的价值（即盗窃数额），或者多次盗窃、入户盗窃、携带凶器盗窃、扒窃等情形。
- 对于偷窃发票的行为，如果仅仅是为了获取发票本身，而发票并不具有直接的货币价值，那么这种行为可能不构成盗窃罪，或者至少不构成数额较大的盗窃罪。
发票涉及的其他法律问题：
- 如果小偷通过偷窃发票来逃避税收、进行诈骗或其他违法犯罪活动，那么这种行为可能构成其他犯罪，如逃税罪、诈骗罪等。
- 此外，即使偷窃发票的行为本身不构成犯罪，也可能构成违反治安管理处罚法的行为，受到相应的行政处罚。
综上所述，小偷偷了电动自行车发票3600元，是否会判刑，需要具体分析偷窃行为的性质、目的以及发票在其中的作用。如果偷窃行为本身不构成犯罪，或者虽然构成犯罪但情节轻微，那么可能不会判刑。然而，如果小偷利用发票进行其他违法犯罪活动，或者偷窃行为本身情节严重，那么就有可能面临刑事处罚。因此，建议受害者及时报警，由公安机关进行调查处理。