因叛逃罪被判处剥夺政治权利的执行主体是公安机关。

分析说明：

根据《中华人民共和国刑事诉讼法》第二百七十条的规定，对被判处剥夺政治权利的罪犯，由公安机关执行。这一规定适用于所有被判处剥夺政治权利的罪犯，无论其是因何种犯罪被判处的。因此，因叛逃罪被判处剥夺政治权利的罪犯，其执行主体同样是公安机关。

在执行过程中，公安机关会依据法律的规定，对罪犯的政治权利进行相应的限制和监督，确保其不得行使被剥夺的政治权利，如选举权和被选举权等。同时，当剥夺政治权利的刑罚执行期满时，公安机关也会书面通知罪犯本人及其所在单位、居住地基层组织，公开宣布恢复其应享有的政治权利。

特殊场景：

值得注意的是，如果罪犯同时被判处了其他刑罚，如有期徒刑、拘役等，并且这些刑罚需要在监狱中执行，那么在监狱执行期间，剥夺政治权利也会由监狱一并执行。但当主刑执行完毕或假释时，附加剥夺政治权利的刑期会从主刑执行完毕之日或假释之日起计算，并由公安机关继续执行，直至剥夺政治权利的期限届满。

结论补充说明：

综上所述，因叛逃罪被判处剥夺政治权利的罪犯，其执行主体是公安机关。这一结论是基于《中华人民共和国刑事诉讼法》的明确规定，并且适用于所有被判处剥夺政治权利的罪犯。在执行过程中，公安机关会依法履行职责，确保刑罚的正确执行，并在执行期满后及时恢复罪犯的政治权利。