驾驶证记3分后又现场抓违法记9分未处理，会影响清分。具体分析如下：

根据相关交通法规，驾驶证的记分周期为12个月，若在一个记分周期内记分达到12分，公安机关交通管理部门应当扣留其机动车驾驶证。对于你提到的驾驶证已经记3分，后又现场被抓违法记9分且未处理的情况，这9分未处理的违法记录会累计记分。

若累计记分达到或超过12分，就会导致驾驶证被扣留，进而影响清分。因此，你需要及时处理这些违法记录。

处理方式如下：

• 你应及时携带驾驶证、行驶证等相关证件到当地交通管理部门违法处理窗口办理违法处理业务，并缴纳罚款。
• 对于现场处罚的违法行为，需在处罚决定规定的时间内缴纳罚款。
• 缴纳罚款后，交通管理部门会对违法记录进行处理，记分相应扣除。
• 待记分周期结束后，若你的记分未达到12分，且已处理的违法记录不再累计，驾驶证可正常清分。

综上所述，建议你尽快处理未处理的违法记录，以避免记分累积过多导致驾驶证被扣留。如有其他疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。