当您在起诉阶段遇到被告公司变更法人的情况时，以下是一些详细的指导和建议，帮助您了解如何应对这一变更并确保诉讼程序的顺利进行。

首先，要明确的是，公司法人变更并不影响诉讼的连续性和有效性。公司是独立承担责任的主体，法人变更不改变其作为诉讼主体的地位，也不影响其应承担的责任和义务。因此，即使被告公司在诉讼期间变更了法人，您的起诉仍然有效，诉讼程序应继续按照既定流程推进。

接下来，您需要采取以下具体步骤：

1. 及时告知法院：

   • 无论是原告方还是被告方，都有义务及时将法人变更情况书面告知法院。
   • 提交相关变更登记文件副本等资料，以便法院更新案件相关主体信息。

2. 提交新法人身份信息和变更证明：

   • 向法院提交新法定代表人的身份证明及变更证明文件。
   • 法院会将新法定代表人列为被告公司的代表参与诉讼。

3. 继续诉讼程序：

   • 变更后的新法定代表人应继续进行诉讼，并负责执行相关的判决、裁定等法律文书确定的义务。
   • 原法定代表人在诉讼过程中已经采取的法律行动（如提起诉讼、提交证据、进行辩论等）仍然有效，不会因为法定代表人的变更而受到影响或失效。

此外，还有一些特殊情况需要注意：

• 如果企业在诉讼期间合并，则由合并后的法人继承原法人地位进行诉讼。
• 如果企业在诉讼期间分立，则以分立后的企业为共同诉讼人参与诉讼。
• 如果企业法人解散，在依法清算并注销前，仍以该企业法人为诉讼当事人；若未依法清算即被注销，则以该企业法人的股东、发起人或者出资人为诉讼当事人。

最后，如果法人变更涉及到公司实体权利义务的重大变化，可能影响案件的审理结果时，法院可能会根据具体情形进行进一步调查核实，或根据当事人的申请调整诉讼策略、追加当事人等。在这种情况下，您应积极配合法院的调查和安排，确保案件的公正、合理审理。

综上所述，当您在起诉阶段遇到被告公司变更法人时，不必过于担心。只要按照上述步骤操作，并确保诉讼程序的顺利进行和诉讼主体的合法性，您的权益将得到充分保障。