针对您提出的问题，当客户违约不配合撤销备案登记时，您可以按照以下步骤进行处理：
一、明确违约责任
首先，您需要仔细审查合同条款，明确客户违约的具体情形以及应承担的违约责任。这包括合同中关于违约行为的定义、违约责任的承担方式以及相关的法律后果等。这将为您后续采取法律措施提供有力的依据。
二、与客户协商
在明确违约责任后，您可以尝试与客户进行协商，要求其承担违约责任并配合办理撤销备案手续。在协商过程中，您可以向客户阐述违约的严重后果，以及配合撤销备案对其自身利益的积极影响，争取客户的理解和配合。
三、采取法律措施
如果协商无果，客户仍然拒绝配合撤销备案登记，那么您可以通过法律途径来维护自己的合法权益。具体做法如下：
收集证据：收集与客户违约相关的证据，如合同文本、交易记录、通信记录等，以证明客户确实存在违约行为。
申请仲裁或提起诉讼：根据合同约定或相关法律法规，您可以向仲裁机构申请仲裁或向法院提起诉讼，要求客户承担违约责任并配合办理撤销备案手续。在申请仲裁或提起诉讼时，您需要提交详细的证据材料和诉状，阐述自己的诉求和理由。
执行裁决或判决：如果仲裁机构或法院作出有利于您的裁决或判决，您可以依据该裁决或判决向房屋管理部门申请撤销备案。在执行过程中，您需要配合房屋管理部门完成相关手续，确保撤销备案的合法性和有效性。
四、注意事项
在处理客户违约不配合撤销备案登记的过程中，您需要注意以下几点：
严格遵守法律法规和程序，确保撤销备案的合法性和有效性。
保持冷静和理性，避免与客户发生不必要的争执和冲突。
积极与客户沟通，争取其理解和配合，以和平解决纠纷为目标。
总之，当客户违约不配合撤销备案登记时，您可以通过明确违约责任、与客户协商、采取法律措施等步骤来维护自己的合法权益。在处理过程中，请务必遵守法律法规和程序，确保撤销备案的合法性和有效性。