当单位在犯罪后注销，起诉的过程需要遵循一定的法律程序和原则。以下是对这一问题的详细解答：

一、确定诉讼主体

1. 若单位未经依法清算即办理注销登记：

   • 应以该单位的股东、发起人或者出资人为诉讼主体（即被告）。

2. 若单位经过清算程序后注销：

   • 应以清算组为诉讼主体。

二、准备起诉材料

1. 起诉状：

   • 起诉状需明确原告与被告的基本信息、诉讼请求、事实与理由等内容。

2. 证据材料：

   • 证据应能充分支持起诉主张，如合同、往来记录、文件、财务凭证等。这些证据对于证明单位犯罪的事实以及个人或清算组应承担的责任至关重要。

三、选择管辖法院

• 一般遵循“原告就被告”的原则，即向被告住所地法院提起诉讼。
• 若存在特殊情形，如合同中有特别约定或法律规定了特殊管辖，则依据相应规定确定管辖法院。

四、提起诉讼与法院审理

1. 向法院提交起诉状及证据材料：

   • 法院将对起诉材料进行审查，以决定是否受理案件。

2. 法院审理过程：

   • 若法院受理案件，将按照法定程序进行审理，包括送达起诉状副本、被告答辩、开庭审理、质证、辩论等环节。
   • 当事人需积极参与诉讼，充分行使自己的诉讼权利，以维护自身合法权益。

五、后续处理

1. 一审判决与上诉：

   • 若对一审判决不服，当事人可在规定期限内上诉至上级法院进行二审程序。

2. 执行与追缴：

   • 若判决生效，当事人需履行判决确定的义务。对于涉及财产的问题，法院将依法进行执行或追缴。

六、特殊注意事项

• 考察单位注销的合法性与正当性：在处理单位犯罪案件时，法院及相关部门将考察单位注销的合法性和正当性。若发现单位为逃避法律责任而恶意注销，将依法追究相关责任人的法律责任。
• 咨询专业法律意见：由于单位犯罪案件涉及复杂的法律问题和程序，建议当事人在处理此类案件时咨询专业的法律顾问或律师以获取具体的法律建议和帮助。

综上所述，单位注销后单位犯罪的起诉过程需要遵循一定的法律程序和原则。当事人需确定适格的被告、准备好起诉状及相关证据材料、选择有管辖权的法院提起诉讼，并积极参与诉讼过程以维护自身合法权益。同时，也需注意考察单位注销的合法性与正当性，并咨询专业的法律意见以确保案件的妥善处理。