在假冒肥料登记证案件中，处罚后的肥料产品是可以被没收的。以下是对这一结论的详细解释：

1. 法律依据：

   • 根据《肥料登记管理办法》第五条，实行肥料产品登记管理制度，未经登记的肥料产品不得进口、生产、销售和使用，不得进行广告宣传。
   • 《肥料登记管理办法》第二十六条第一项规定，生产、销售未取得登记证的肥料产品，由县级以上农业行政主管部门给予警告，并处违法所得3倍以下罚款，但最高不得超过30000元；没有违法所得的，处10000元以下罚款。同时，该条款并未明确排除对违法肥料产品的没收措施。

2. 实际案例：

   • 在金华市农业农村局处理的某农资经营部销售未取得登记证的肥料产品案中，除了对经营部进行警告和罚款外，还明确没收了违法所得和违法肥料产品。
   • 在四会市农业农村局处理的潘某农资店销售假冒肥料登记证的肥料产品案中，同样对假冒肥料登记证的肥料产品进行了没收。

3. 法律逻辑：

   • 肥料产品未经登记或假冒登记证，意味着其可能不符合国家质量标准或存在安全隐患，对农业生产和农民利益构成威胁。
   • 因此，为了维护市场秩序和农民利益，农业行政主管部门在查处此类违法行为时，有权采取包括没收违法肥料产品在内的措施。

综上所述，假冒肥料登记证案件处罚后的肥料产品是可以被没收的。这一措施不仅符合法律法规的规定，也是维护市场秩序和农民利益的必要手段。如果您在此类案件中遇到任何问题或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。