协议原件毁了，复印件在一定条件下是有效的。具体分析如下：

1. 法律效力：

   • 尽管原件被销毁，但只要留存有完整的复印件，该复印件依然可能具有法律效力。然而，其法律效力并非绝对，而是需要结合其他辅助性证据进行综合分析与判断。
   • 如果在合同履行过程中引发纠纷并需要向法院提起诉讼，根据法律规定的证据提供程序以及举证责任的分配原则，若相对方对复印件持有异议且未能出示原始合同原件，这可能会加重举证困难，并对提出诉求的一方形成不利局面。

2. 证明作用：

   • 复印件若能清晰反映协议的关键条款、双方签字盖章等重要信息，且与其他证据（如双方履行协议的相关凭证、往来沟通记录等）相互印证，则可能被法院认可具有一定证明力。
   • 若仅有复印件而无其他有力证据佐证，其证明力相对较弱，可能难以单独作为认定协议有效的依据。

3. 司法实践：

   • 在司法实践中，法院通常会综合考量各方面因素来判断复印件能否作为认定事实的依据。这包括但不限于复印件的清晰度、内容的完整性、与其他证据的关联性等。
   • 因此，协议原件毁损后，复印件的法律效力不能一概而论，而是需要结合具体证据情况综合判定。

综上所述，协议原件毁了后，复印件在一定条件下仍然有效，但其法律效力并非绝对，而是需要依赖于其他辅助性证据来增强证明力。在涉及法律纠纷时，建议尽可能收集并提供与复印件相关的其他证据，以增强其证明力并维护自身合法权益。