对企业会有一定影响，但具体影响取决于多种因素。

首先，我们需要明确，申请行政复议是企业对行政机关作出的具体行政行为不服时，依法向行政复议机关提出审查该具体行政行为的申请，并请求行政复议机关作出决定的一种法律救济途径。当企业对资质审核结果有异议时，申请行政复议是其合法权益的体现。

接下来，我们分析申请行政复议对企业可能产生的影响：

1. 行政程序上的影响：

   • 申请行政复议意味着企业需要投入一定的时间和精力去准备复议材料、参与复议程序。这可能会暂时分散企业的注意力，尤其是在复议期间，企业可能需要配合行政复议机关的调查和询问。
   • 如果复议结果维持原资质审核决定，企业可能需要接受这一结果，并考虑是否进一步采取法律措施（如提起行政诉讼）。

2. 商业信誉和声誉的影响：

   • 虽然申请行政复议本身不一定直接损害企业的商业信誉和声誉，但如果复议过程中涉及的信息被不当传播或误解，可能会对企业的公众形象产生一定影响。
   • 如果复议结果对企业不利，且被公开，那么可能会对企业的市场形象和客户信任度产生负面影响。

3. 经济成本的影响：

   • 申请行政复议可能需要支付一定的费用，如复议申请费、律师费等（尽管在某些情况下，这些费用可能由行政复议机关承担或得到部分减免）。
   • 如果复议期间企业的正常业务受到影响，如因资质问题被暂停业务，那么还可能产生间接的经济损失。

4. 法律后果的不确定性：

   • 复议结果具有不确定性，企业可能面临复议被驳回、资质被撤销或降级等不利后果。
   • 如果复议成功，企业可能恢复或获得更有利的资质，从而有利于其业务发展。

综上所述，申请行政复议对企业会有一定影响，但具体影响程度取决于复议过程、结果以及企业自身的应对情况。因此，企业在决定申请行政复议前，应充分评估其可能带来的利弊，并咨询专业律师的意见。如果你在这方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。