无证驾驶三轮摩托被交警扣车且未开扣车证明，交警的行为存在程序瑕疵，你有权要求交警部门补开扣车证明并说明扣车理由。

一. 无证驾驶的法律后果

1. 无证驾驶的定义：根据《中华人民共和国道路交通安全法》第十九条，驾驶机动车，应当依法取得机动车驾驶证。未取得机动车驾驶证而驾驶机动车的，属于无证驾驶。
2. 无证驾驶的处罚：无证驾驶的，由公安机关交通管理部门处二百元以上二千元以下罚款，可以并处十五日以下拘留。

二. 交警扣车的法律依据与程序

1. 扣车的法律依据：根据《道路交通安全违法行为处理程序规定》第二十七条，有下列情形之一的，依法扣留车辆：（一）上道路行驶的机动车未悬挂机动车号牌，未放置检验合格标志、保险标志，或者未随车携带机动车行驶证、驾驶证的……（此处列举了多种扣车情形，包括无证驾驶）。
2. 扣车的程序要求：交警在扣车时，应当告知当事人扣车的理由和依据，并开具扣车证明。这是保障当事人合法权益的重要程序。

三. 未开扣车证明的处理

1. 程序瑕疵的指出：交警在扣车时未开具扣车证明，属于程序上的瑕疵。你有权向交警部门提出异议，要求补开扣车证明并说明扣车理由。
2. 维护自身权益：如果交警部门拒绝补开扣车证明或无法提供合理的扣车理由，你可以通过行政复议或行政诉讼等法律途径来维护自己的合法权益。

我建议：你可以首先尝试与交警部门沟通，要求他们补开扣车证明并说明扣车理由。如果沟通无果，你可以考虑通过法律途径来维护自己的权益。同时，你也应当认识到无证驾驶的严重性，并尽快考取机动车驾驶证，以避免类似的法律纠纷再次发生。如有进一步需要，您可以继续咨询我。