员工工作时间去厕所摔倒，一般应当认定为工伤。下面我将从多个角度对此进行详细解释：

1. 根据《工伤保险条例》的相关规定：

   • 根据《工伤保险条例》第十四条第（一）款，职工在工作时间和工作场所内，因工作原因受到事故伤害的，应当认定为工伤。
   • 在此案例中，员工在工作时间（正常上班期间）去厕所，厕所作为用人单位内部的配套设施，属于工作场所的合理延伸。
   • 上厕所是人类的基本生理需求，是为了维持正常工作状态而进行的合理、必要的活动，因此可以视为因工作原因。

2. 具体情形分析：

   • 若厕所地面湿滑等，用人单位管理不善导致有安全隐患，且摔跤与工作场所不安全因素有直接因果关联，通常可认定为工伤。
   • 若因职工自身突发疾病（如低血糖）而摔跤，且与工作无直接关系，一般不能认定为工伤。
   • 若职工在正常上厕所途中因个人行为（如嬉戏打闹等）而不慎摔跤，也难以认定为工伤。

3. 工伤认定的关键要素：

   • 工作时间：员工摔倒发生在正常工作时间内。
   • 工作场所：用人单位内部的卫生间设施属于工作场所的合理延伸。
   • 工作原因：上厕所是基本生理需求，与正常工作密不可分。

4. 申请工伤认定的流程：

   • 若符合上述条件，职工或其近亲属、工会组织可在规定时间内向统筹地区社会保险行政部门提出工伤认定申请。
   • 社会保障行政部门将根据实际情况进行判断，并作出是否认定为工伤的决定。

综上所述，员工工作时间去厕所摔倒，在大多数情况下应当认定为工伤。但具体认定结果还需根据社会保障行政部门的判断以及实际情况来确定。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。