针对行政执法过程中当事人不配合调查的情况，执法人员可以采取以下措施来应对：

首先，执法人员应明确告知当事人不配合行为的法律后果及其应尽的义务。这可以通过口头警告、责令改正等方式进行，旨在敦促当事人积极配合执法工作。告知时，执法人员需保持清晰、准确，确保当事人能够充分理解其行为的法律意义及可能带来的后果。

若当事人仍然拒绝配合，执法人员可依法进行调查取证工作。在这一过程中，执法人员应充分利用各种合法手段来固定相关证据，如通过见证人见证、使用执法记录仪等视频采集设备等方式，以增强证据的证明力。同时，执法人员还需注意调查取证的严谨性和细致性，确保证据的真实性和有效性。

当证据收集充分后，执法部门可根据法律规定作出行政处罚决定，并将该决定送达给当事人。送达时，需遵循法定程序，确保当事人的合法权益得到保障。若当事人在规定的期限内不履行处罚决定，执法部门可依法向法院申请强制执行。

在整个执法过程中，执法人员务必确保执法程序的合法性与合规性。这是保障当事人合法权益的关键，也是维护行政执法权威性和公正性的重要基础。同时，执法人员还应注重与当事人的沟通，尽量减少冲突，通过耐心解释和劝导来争取当事人的理解和配合。

此外，对于当事人拒绝接受调查询问或无法找到当事人的情况，执法部门还可以采取下达协助调查询问通知书、留置送达或公告送达等方式来进一步推动执法工作的进行。这些措施旨在确保执法工作的全面性和有效性，同时也为“拒绝配合行政执法”提供了有力的法律佐证。

综上所述，面对当事人不配合调查的情况，执法人员应依法依规进行处理，通过明确告知、调查取证、作出处罚决定等步骤来维护行政执法的权威性和公正性。同时，也需注重保障当事人的合法权益，确保执法工作的合法性和合规性。