如果车钥匙已经妥善保管但还是被偷，且因此发生事故，车主一般不需要承担责任。以下是详细分析：

一. 车主的责任判定

1. 妥善保管的定义：妥善保管车钥匙意味着车主已经采取了合理的措施来确保车钥匙不被未经授权的人获取。例如，将车钥匙放在安全的地方，如个人随身携带或锁在抽屉里。
2. 车主无过错的情形：如果车主已经妥善保管了车钥匙，但车钥匙仍然被偷，这通常意味着车主在保管车钥匙方面没有过错。在这种情况下，如果小偷使用偷来的车钥匙驾车发生事故，车主通常不需要对事故承担责任。

二. 法律依据

• 《中华人民共和国民法典》第一千二百一十二条：“未经允许驾驶他人机动车，发生交通事故造成损害，属于该机动车一方责任的，由机动车使用人承担赔偿责任；机动车所有人、管理人对损害的发生有过错的，承担相应的赔偿责任，但是本章另有规定的除外。”
• 在此案例中，由于车主已经妥善保管了车钥匙，且对小偷的偷窃行为无法预见和防止，因此车主对损害的发生没有过错，不需要承担赔偿责任。

三. 实际案例的启示

• 参考新会法院审结的一起因偷拿他人车钥匙驾车引发的机动车交通事故责任纠纷案件，法院认定，如果车主已经尽到妥善保管钥匙的义务，但车钥匙仍然被偷并导致事故，车主通常不需要承担责任。这进一步支持了上述观点。

我建议：车主应时刻注意保管好车辆和车钥匙，采取合理的安全措施，以防止车钥匙被盗用。如果车钥匙不幸被偷，且因此发生事故，车主应积极配合警方调查，并提供相关证据以证明自己已经尽到妥善保管的义务。如有进一步需要，您可以继续咨询我。