未经同意在别人果园修路多年后被阻止通行，一般不具有法律效力。具体分析如下：

首先，从物权法的角度来看，果园属于果园主人的私人财产，其享有对果园的占有、使用、收益和处分的权利。未经果园主人同意，擅自在其果园内修路，侵犯了果园主人的物权。即使这种修路行为已经持续多年，也不能因此取得合法的通行权。果园主人有权随时要求停止侵害、恢复原状，并有权要求赔偿因此造成的损失。

其次，从合同法的角度来看，如果修路行为是基于某种合同关系而进行的，那么应当考察合同的具体内容。如果合同中明确规定了修路的目的、期限、方式以及通行权等条款，并且双方当事人都按照合同约定履行了义务，那么在这种情况下，可能会产生一定的法律效力。然而，在本问题中并未提及任何合同关系，因此无法从合同法的角度为擅自修路行为提供合法性依据。

最后，从侵权责任法的角度来看，擅自修路并在果园内通行，可能会对果园造成损害，如破坏果树、影响果园的正常经营等。果园主人有权要求侵权人承担侵权责任，包括停止侵害、排除妨碍、消除危险、赔偿损失等。

综上所述，未经同意在别人果园修路多年后被阻止通行，一般不具有法律效力。如果因此产生纠纷，建议双方通过协商、调解或诉讼等方式解决。在协商或调解过程中，可以考虑双方的实际利益和需求，寻求合理的解决方案。如果无法协商或调解，可以向人民法院提起诉讼，由法院依法判决。