关于医院办理慢特病是否需要手持身份证照片的问题，这主要取决于具体的办理流程和地区政策。从您提供的参考信息来看，至少在某些地区，如衡南和永州，线上申请门诊慢特病待遇延期时，确实需要上传个人手持身份证的半身照片。
这种做法的合法性可以从以下几个方面来理解：
政策依据：根据湖南省医疗生育保险服务中心的相关文件，如《关于优化门诊慢特病复审流程的通知》，明确指出了线上申请延期所需提交的材料，其中包括个人手持身份证的照片。这表明，在政策层面上，这种做法是得到支持的。
信息安全与隐私保护：虽然要求上传个人手持身份证的照片可能引发一些对信息安全和隐私保护的担忧，但通常这类线上平台会采取一系列措施来确保用户数据的安全。例如，使用加密技术传输和存储数据，设置访问权限和审计日志等。因此，只要用户遵循平台的使用规定，个人信息的安全是可以得到保障的。
便捷性与效率：线上申请并上传相关材料可以大大提高办理效率，减少纸质材料的提交和线下跑腿的次数。对于需要定期复审的慢特病患者来说，这无疑是一种更加便捷的方式。
综上所述，从政策依据、信息安全与隐私保护以及便捷性与效率等方面来看，医院办理慢特病要求上传手持身份证照片的做法在一定条件下是合法的，并且也是出于提高办理效率和便捷性的考虑。当然，具体做法可能因地区和政策的不同而有所差异，建议咨询当地医保部门或医院以获取最准确的信息。