企业主体灭失的认定主要涉及到企业的法律状态和存续情况。通常，企业主体灭失指的是企业法人资格的终止，这往往与企业注销、吊销或撤销等法律程序紧密相关。以下是对企业主体灭失认定的详细解答：
一、企业注销
定义：注销登记是指登记主管机关依法对歇业、被撤销、宣告破产或者因其他原因终止营业的法人，取消法人资格的行为。完成法人注销登记时，法人终止。
法律后果：注销是企业退出市场的唯一方式，经注销后企业法人资格不复存在，企业法人的民事主体资格自注销时亦不复存在。这意味着企业不再具有从事任何法律活动的资格。
注销程序：企业可以按照法定程序向登记机关申请注销，经过清算、公告等程序后，登记机关会注销公司登记，终止公司法人资格。新《公司法》还增设了公司简易注销程序，对于债权债务关系简单的公司，可以经过更简便的程序注销公司登记。
二、企业吊销
定义：吊销是工商行政管理机关依据国家工商行政法规对违法的企业法人作出的取消其生产经营资格的一种行政处罚。
法律后果：被吊销后，企业丧失从事生产经营活动的资格，不能进行新的经营活动。但吊销并不终止企业的法人资格，企业仍需进行清算，清算结束后才能申请注销公司登记，从而终止企业的法人资格。
后续处理：被吊销的企业法人在被吊销营业执照至清算程序结束期间，法律人格仍然存续。企业应当在被吊销后十五日内成立清算组进行清算，逾期不成立清算组进行清算的，利害关系人及作出吊销营业执照决定的部门或者公司登记机关可以申请人民法院指定有关人员组成清算组进行清算。
三、企业撤销
定义：撤销是指工商行政主管部门或者其上级行政机关根据利害关系人的请求或依据职权，作出的撤销行政行为的决定。
法律后果：撤销也是公司解散的情形之一，被撤销后企业同样需要进行清算，待清算后申请公司注销登记，终止公司法人资格。
四、企业主体灭失的认定标准
综上所述，企业主体灭失的认定主要依据企业的法律状态和存续情况。具体来说，当企业完成注销登记时，其法人资格终止，企业主体灭失。此外，当企业被吊销或撤销后，如果未按照法定程序进行清算和注销登记，虽然其法人资格在法律上仍然存在，但实际上企业已经停止了经营活动，也可以视为企业主体的一种灭失状态。然而，这种状态下的企业仍然需要按照法定程序进行清算和注销登记，以正式终止其法人资格。
因此，在认定企业主体是否灭失时，需要综合考虑企业的注册状态、经营状态以及是否按照法定程序进行了清算和注销登记等因素。