当然可以起诉。如果你的维修费用超出了邻居的赔偿费用，你有权向法院提起诉讼，要求邻居承担全部的维修费用。

分析说明：

1. 侵权责任的承担：邻居淹水导致你遭受损失，这构成了一种侵权行为。根据《民法典》的相关规定，侵权人应当承担侵权责任，包括赔偿被侵权人因此受到的损失。如果邻居的赔偿费用不足以覆盖你的维修费用，你有权要求邻居承担剩余的维修费用。

2. 诉讼的合理性：当双方无法就赔偿问题达成一致时，通过诉讼来解决纠纷是一种合法且有效的途径。在诉讼过程中，你可以提供相关证据来证明你的损失和维修费用的合理性，法院将根据事实和法律规定来作出公正裁决。

3. 诉讼前的准备：在提起诉讼之前，建议你先收集好相关证据，如维修费用清单、照片、视频等，以证明你的损失和维修费用的真实性。同时，你也可以尝试与邻居进行协商，看是否能够达成和解，避免不必要的诉讼成本和时间投入。

行动建议：

• 收集证据：首先，你需要收集所有与淹水事件和维修费用相关的证据，包括但不限于维修合同、发票、照片、视频等。
• 咨询专业意见：虽然我可以为你提供法律建议，但在具体诉讼过程中，你可能还需要咨询当地的律师或法律专家，以获取更具体的法律帮助。
• 提起诉讼：如果协商无果，你可以向当地法院提起诉讼，要求邻居承担剩余的维修费用。在诉讼过程中，请务必遵循法院的程序和要求，提供充分的证据来支持你的主张。