被执行人的厂房在被执行人持股百分之百的情况下拍卖，是需要进行评估的。以下是详细的分析：

1. 评估的必要性：

   • 在执行过程中，无论被执行人对厂房的持股比例是多少，为了确定厂房的公平市场价值，确保拍卖价格的公正性，都需要进行专业的评估。
   • 评估结果将作为拍卖起拍价的重要参考，有助于保障债权人和债务人的合法权益。

2. 评估的流程：

   • 通常，法院会委托具有专业资质的评估机构对厂房进行评估。
   • 评估机构会综合考虑厂房的地理位置、建筑面积、使用年限、市场状况等因素，给出客观的评估报告。

3. 特殊情况的处理：

   • 如果被执行人对厂房的持股比例为百分之百，且厂房的价值较为明确，双方当事人对价值无争议，理论上可以协商确定拍卖价格，但这种情况较为罕见。
   • 在大多数情况下，为了保障拍卖的公正性和透明度，仍然需要进行专业的评估。

综上所述，被执行人的厂房在被执行人持股百分之百的情况下拍卖，是需要进行评估的。这是为了确定厂房的公平市场价值，保障拍卖的公正性和透明度。如果你对此有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。