公司牵扯正在被民事起诉时，通常不能办理注销。以下是对此结论的详细解释：

1. 注销条件限制：根据相关法律法规，公司在申请注销前，需要确保没有未了结的民事、行政或刑事案件。若公司存在正在进行的民事起诉，意味着存在未解决的法律纠纷，这不符合注销的条件。

2. 法律程序要求：民事起诉涉及法律程序，包括诉讼、调解、判决等。在公司注销前，必须完成这些法律程序，并妥善处理所有相关的法律事务。否则，注销申请将不会被受理，或者即使受理也会被驳回。

3. 债权人权益保护：公司注销会直接影响债权人的权益。若公司在有未了结民事案件的情况下注销，可能会损害债权人的合法权益。因此，法律要求公司在注销前必须妥善处理所有与债权人的关系，包括清偿债务或达成和解。

4. 注销后的法律后果：即使公司尝试在有未了结民事案件的情况下注销，注销后的法律实体仍然存在，且可能需要承担相应的法律责任。此外，公司注销后的资产清算和分配也可能受到法律限制和影响。

综上所述，公司在牵扯正在被民事起诉时，通常不能办理注销。建议公司在处理完所有法律事务后再考虑注销事宜。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。