关于非法捕捞罪自首投案的处理方式，以下是我为您提供的详细解答：

首先，非法捕捞罪是指违反保护水产资源法规，在禁渔区、禁渔期或者使用禁用的工具、方法捕捞水产品，情节严重的行为。对于这一罪行，法律有明确的处罚规定。

当犯罪嫌疑人选择自首投案时，其处理流程通常如下：

1. 主动投案：

   • 犯罪嫌疑人需要主动向公安机关、人民检察院或者人民法院投案，并如实供述自己的罪行。这是自首的基本条件。

2. 如实供述：

   • 在投案过程中，犯罪嫌疑人必须如实交代自己的全部罪行，包括非法捕捞的具体时间、地点、使用的工具、捕捞的水产品数量及价值等，以及是否有其他同案犯等。

3. 法律程序：

   • 公安机关会对投案自首的犯罪嫌疑人进行审查，确认其是否构成自首，并收集相关证据。
   • 如果确认构成自首，公安机关会依法对犯罪嫌疑人采取相应的强制措施，如取保候审等，并移送检察机关审查起诉。
   • 检察机关会对案件进行审查，确认犯罪事实和证据是否充分，然后依法向法院提起公诉。

4. 量刑考虑：

   • 在量刑环节，法院会充分考虑犯罪嫌疑人的自首情节。根据《中华人民共和国刑法》的相关规定，对于自首的犯罪分子，可以从轻或者减轻处罚。
   • 具体量刑时，法院会综合考虑犯罪嫌疑人的犯罪情节、社会危害程度、自首的主动性和及时性等因素，作出公正的裁决。

5. 修复生态环境：

   • 如果犯罪嫌疑人能够积极采取有效措施修复受损的生态环境，如投放鱼苗、恢复水域生态等，这也可以作为量刑时的一个考虑因素，可能会进一步减轻处罚。

综上所述，对于非法捕捞罪的自首投案，法律有明确的处理流程和量刑规定。犯罪嫌疑人如果能够主动投案、如实供述并积极修复生态环境，那么在量刑时可能会得到适当的减轻处罚。但具体的定罪量刑还需要法院根据案件的具体情况和法律规定来作出公正的裁决。