商品保质期内变质能否赔偿1000元，需根据具体情况分析。以下是详细解答：

1. 若商品为食品：

   • 根据《中华人民共和国食品安全法》第一百四十八条第二款，若生产或经营的食品不符合食品安全标准，消费者除要求赔偿损失外，还可要求支付价款十倍或损失三倍的赔偿金。若增加赔偿的金额不足一千元，则按一千元计赔。
   • 举例：若你购买了价值50元的食品，在保质期内变质，且没有造成其他额外损失，你除要求赔偿实际损失（如退货退款）外，还可要求支付500元（价款十倍）的赔偿金。但由于这个金额低于1000元，因此你可以要求赔偿1000元。

2. 若商品为非食品：

   • 对于非食品类商品，如化妆品、日用品等，在保质期内变质，不适用《食品安全法》的惩罚性赔偿规定。
   • 在这种情况下，赔偿金额将依据《中华人民共和国民法典》或《中华人民共和国消费者权益保护法》的相关规定，根据商品的实际价值或造成的实际损失来确定。
   • 举例：若你购买了价值200元的日用品，在保质期内变质，且商家存在过错，你可以要求商家按商品的实际价值或造成的实际损失进行赔偿，但不一定能达到1000元。

3. 额外考虑因素：

   • 若商家存在欺诈行为，如明知商品变质仍出售，根据《消费者权益保护法》的相关规定，消费者可以要求增加赔偿，金额为商品价款的三倍，且最低不少于500元。
   • 在维权过程中，务必保留好购物凭证、商品照片等相关证据，以便在协商不成时向消费者协会求助或向法院提起诉讼。

综上所述，商品在保质期内变质，能否获得1000元赔偿需根据商品类型、实际损失及商家行为等因素综合判断。若你遭遇此类问题，建议首先与商家协商，协商不成时可考虑通过法律途径维护自身权益。