关于未成年人无证驾驶电动摩托车被拘留是否会有案底的问题，我们可以得出以下结论：
未成年人无证驾驶电动摩托车被拘留，通常不会留下刑事案底，但会有相应的违法记录存档在公安机关的交通管理部门。
首先，我们需要明确“案底”的含义。案底通常指的是犯罪记录，即某人过去犯法或犯罪行为的记录。对于未成年人无证驾驶电动摩托车的行为，它属于违反《道路交通安全法》的违法行为，但并不构成犯罪。因此，这一行为不会留下刑事案底。
具体来说：
无证驾驶的处罚：根据《道路交通安全法》的规定，未取得机动车驾驶证驾驶机动车的，由公安机关交通管理部门处二百元以上二千元以下罚款，并可以并处十五日以下拘留。这是针对无证驾驶行为的行政处罚，而非刑事处罚，所以不会形成刑事案底。
违法记录的影响：虽然不留刑事案底，但无证驾驶的违法行为会被记录在公安机关的交通管理系统中。这一记录可能会对未成年人今后考取机动车驾驶证等产生一定影响。如果再次因无证驾驶被查处，处罚可能会更加严厉，甚至可能影响到个人的信用记录和其他方面的生活。
未成年人的特殊保护：特别值得注意的是，对于未成年人而言，我国法律有其特殊的保护机制。如果未成年人犯罪时未满十八周岁且被判处五年有期徒刑以下刑罚，其相关犯罪记录应当被封存，不得向任何单位和个人提供，除非特定情况下的司法办案或国家规定查询。因此，在未成年人无证驾驶的情况下，更不太可能留下长期影响的案底。
综上所述，未成年人无证驾驶电动摩托车被拘留不会留下刑事案底，但会有违法记录存档。同时，我也要提醒未成年人及其监护人，无证驾驶是非常危险的行为，不仅可能危及自身安全，还可能给他人带来严重伤害。因此，应严格遵守交通法规，不要无证驾驶。如果有任何法律问题或需要进一步的法律咨询，请随时向我提问。