被法院查封的动产能否以善意为由转移，其核心在于查封是否公示以及第三人的善意程度。

1. 查封未公示，可对抗善意第三人：根据最高人民法院《关于人民法院民事执行中查封、扣押、冻结财产的规定》以及《关于人民法院执行工作若干问题的规定(试行)》的相关规定，法院在查封动产时，应当采取加贴封条、张贴公告或其他足以公示查封、扣押的适当方式。若法院查封动产未进行公示，则其效力不得对抗善意第三人。在此情况下，如果第三人确实不知晓该动产已被查封，并且符合善意取得的其他条件（如合理价格、已实际交付等），则有可能善意取得该动产的所有权。

2. 查封已公示，不可对抗善意第三人：相反，如果法院已经对动产进行了查封，并且采取了适当的公示措施（如加贴封条、发布公告等），则此查封行为具有对抗善意第三人的效力。在此情况下，无论第三人是否知晓该动产已被查封，只要其未能满足善意取得的所有条件，就不能取得该动产的所有权。

3. 指示交付的特殊情况：在动产指示交付的情形下，应将通知直接占有人作为认定指示交付完成的条件。如果贸易公司或仓储公司等未能将其提货请求权转移的事实通知直接占有人（如实业公司），则不能视为完成了交付义务。在此情况下，即使第三人是善意的，并且支付了合理价格，但由于交付未完成，也不能善意取得该动产的所有权。

综上所述，被法院查封的动产能否以善意为由转移，取决于查封是否进行了公示以及第三人的善意程度和交付情况。如果您在具体案件中遇到此类问题，建议咨询专业律师以获取更准确的法律意见。