淘宝网上经营医疗器械的店铺并不都合法。具体分析如下：

1. 法规要求：

   • 根据《医疗器械监督管理条例》及相关规定，从事第二、三类医疗器械经营的，必须是经营企业，且需取得经营许可或备案凭证。
   • 医疗器械网络销售经营者也需“持证上岗”，除第一类及免于备案的第二类医疗器械外，必须取得生产经营许可备案及网络销售企业备案，自建网站销售还需完成互联网药品信息服务备案。

2. 现实情况：

   • 淘宝网上存在众多经营医疗器械的店铺，但并非所有店铺都具备合法的经营资质。
   • 有些店铺可能未经许可就擅自销售第二类、第三类医疗器械，或者销售未备案的第二类医疗器械，这些都是违法的。

3. 法律后果：

   • 未经许可从事第二类、第三类医疗器械生产经营，或经营未备案的第二类医疗器械，一旦货值金额超过1万元，将被处货值金额15至30倍罚款。
   • 情节严重的，企业会被吊销许可证，10年内不得再申请许可，法定代表人及相关责任人还将被没收违法所得，并处收入30%至3倍罚款，终身禁止从事医疗器械行业。

4. 建议：

   • 消费者在淘宝网上购买医疗器械时，应仔细查看店铺的经营资质和产品的注册、备案信息。
   • 如发现店铺存在违法经营行为，应及时向相关部门举报。

综上所述，淘宝网上经营医疗器械的店铺并不都合法，消费者在购买时应谨慎选择，确保购买到合法、安全的医疗器械。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。