针对您提出的“车主交通肇事罪入刑后赔偿款怎么执行”的问题，以下是我为您提供的详细解答：

首先，需要明确的是，交通肇事判刑并不影响民事赔偿责任的承担。刑事责任与民事赔偿责任是相互独立的，即使车主因交通肇事罪被判刑，他仍然需要承担因交通事故造成的民事赔偿责任。

关于赔偿款的执行，具体可以分为以下几个步骤：

一、赔偿责任的确定

1. 交警部门会进行事故责任认定，划分各方在事故中的责任比例，这是确定赔偿责任的重要依据。
2. 肇事者需根据其责任比例承担相应的民事赔偿责任，赔偿范围包括但不限于医疗费、误工费、护理费、交通费等各项损失。

二、赔偿方式的选择

1. 协商与调解：双方可以就赔偿金额和方式进行协商，或者请求公安机关交通管理部门进行调解，争取达成赔偿协议。
2. 法律诉讼：如果协商或调解不成，受害者可以在刑事案件审理过程中提起刑事附带民事诉讼，或者在刑事案件审结后单独向法院提起民事诉讼，要求肇事者承担民事赔偿责任。

三、赔偿款的执行

1. 自动履行：如果肇事者具有赔偿能力且愿意主动履行，他可以按照法院判决或双方协议确定的金额、方式和期限支付赔偿款。
2. 强制执行：如果肇事者不主动履行赔偿义务，受害者可以在规定期限内向法院申请强制执行。法院有权采取多种强制措施，如查询、冻结、划拨肇事者的银行存款，查封、扣押、拍卖其财产等，以确保受害者能够获得应有的赔偿。

此外，如果肇事车辆购买了保险，保险公司也应在保险责任限额内承担相应的赔偿责任。受害者可以向保险公司提出索赔要求，并提供相关证据和材料。

综上所述，车主交通肇事罪入刑后，赔偿款的执行主要依赖于法院的判决和肇事者的履行能力。受害者应通过合法途径积极寻求赔偿，并密切关注赔偿款的执行情况。如果肇事者不主动履行赔偿义务，受害者可以及时向法院申请强制执行，以确保自己的合法权益得到保障。