针对您提出的小区改造中大家担心树木被破坏的问题，以及如何向有关部门提交意见，以下是我的详细解答：
首先，结论前置：
您可以通过书面形式，如联名信或建议书，向小区所在的街道办事处、居委会或相关改造项目的负责部门提交您的意见和诉求，明确表达大家对保护树木的关切，并请求在改造过程中采取妥善措施保护这些树木。
接下来，详细解答：
明确表达意见：
- 在提交的意见中，首先要明确表达大家对小区内树木的重视和保护意愿，说明这些树木对小区环境、居民生活以及社区文化的重要性。
- 提出具体的保护建议，比如要求改造方案中包含树木保护计划，确保在施工过程中不破坏树木或尽量减少对树木的影响。
确定提交对象：
- 根据小区改造项目的具体情况，确定提交意见的对象。通常是街道办事处、居委会或负责改造项目的相关部门。
- 可以通过查询小区公告、咨询物业或居委会等方式，了解改造项目的负责部门和联系方式。
准备必要的材料：
- 联名信或建议书：由小区居民联名签署，表达大家的共同意愿。
- 树木照片或清单：附上小区内树木的照片或清单，以便相关部门了解具体情况。
- 相关法律法规依据：可以附上相关法律法规中关于树木保护的规定，增强意见的说服力。
提交方式：
- 可以选择将意见材料直接送至相关部门的办公地点。
- 也可以通过邮寄、电子邮件等方式提交，确保意见能够准确、及时地传达给相关部门。
跟进与反馈：
- 提交意见后，可以主动与相关部门联系，了解他们对意见的反馈和处理情况。
- 如果部门未给予及时回应或处理不当，可以考虑通过媒体、社区论坛等方式扩大影响力，争取更多的支持和关注。
最后，法律建议：
- 在提交意见和诉求时，请保持理性、客观的态度，避免使用过激或不当的言辞。
- 如果在树木保护问题上与相关部门产生争议或纠纷，可以寻求法律援助或咨询专业律师（如我），通过法律途径维护大家的合法权益。
希望以上解答能够对您有所帮助。如果您在小区改造或树木保护方面还有其他问题或疑虑，欢迎随时向我咨询。