非法收购废电池主要由生态环境主管部门管理。具体分析如下：

废电池属于危险废物，其非法收购、贮存、处置等行为，都可能对环境造成污染，因此受到严格的法律监管。在我国，生态环境主管部门负责危险废物的监督管理工作，包括废电池的收购、贮存、运输、处置等各个环节。

对于非法收购废电池的行为，生态环境主管部门有权进行查处，并依据相关法律法规对违法者进行处罚。同时，为了加强废电池的管理，防止环境污染，我国还实行了一系列的管理制度和措施，如危险废物经营许可证制度、危险废物转移联单制度等，以确保废电池的合法、安全处置。

因此，如果发现有人非法收购废电池，应及时向当地的生态环境主管部门举报，以维护环境安全和公共利益。同时，也建议相关企业和个人加强环保意识，合法合规地处理废电池等危险废物。