房屋交接书遗失后，房产确权的诉讼流程主要包括以下步骤：

一. 准备起诉材料并提交

1. 撰写起诉书：原告需要详细载明原告和被告的基本信息，诉讼请求，事实与理由，证据及证据来源等。
2. 收集并整理证据：尽管房屋交接书遗失，但原告应尽可能收集其他相关证据，如房产证、购房合同、付款凭证等，以证明自己的主张。
3. 向房屋所在地的辖区法院提交起诉书和证据：根据《中华人民共和国民事诉讼法》第三十四条的规定，因不动产纠纷提起的诉讼，由不动产所在地人民法院管辖。

二. 法院审查并决定是否立案

1. 法院审查：人民法院在收到起诉书后，会在七日内进行审查，决定是否立案。
2. 立案条件：立案需满足原告与案件有直接利害关系，有明确的被告，有具体的诉讼请求和事实理由，且属于法院受理民事诉讼的范围和管辖。

三. 案件受理及交费

1. 案件受理：一旦案件被受理，法院会发出《案件受理通知书》和《举证通知书》。
2. 交纳诉讼费用：原告需在规定期限内交纳诉讼费，否则将视为撤回起诉。

四. 举证期限内提交证据

1. 提交证据：在法院指定的举证期限内，原告需提交全部证据材料。
2. 申请延期举证：如因客观原因无法在规定期限内提交证据，原告可以向法院申请延期举证，但需经法院批准。

五. 等待开庭，法庭调解和宣判

1. 等待开庭：提交完证据后，原告需等待法院安排开庭。
2. 法庭调解和宣判：在开庭审理过程中，法院会组织双方进行法庭调查和法庭辩论，以查明案件事实。如果双方同意调解，法院会进行调解；如果调解不成或一方不同意调解，法院会根据查明的事实和法律规定进行宣判。
3. 上诉权利：宣判后，如果一方不服判决结果，可以在法定期限内向上一级法院提起上诉。

六. 申请协助执行

1. 申请协助执行：如果最终得到确权判决，原告应及时申请法院给房管部门发出协助执行通知书，以办理产权登记。

我的观点：在房屋交接书遗失的情况下，房产确权的诉讼流程虽然复杂，但原告只要按照上述步骤操作，并尽可能收集其他相关证据，仍有可能成功确权。在整个过程中，保持与法院的沟通，确保所有程序都按照法律规定进行，是至关重要的。如有进一步需要，您可以继续咨询我。