当合作伙伴单方毁约时，赔偿的处理方式主要依据合作协议中的违约条款以及相关法律法规。以下为您提供清晰、详细、有深度的解答：

一、查看合作协议

首先，您需要仔细查看合作协议中是否包含违约条款。

• 若协议中有违约条款：守约方可以依据这些条款要求违约方承担违约责任，如支付违约金、赔偿损失等。这些条款通常会明确违约金的数额或计算方式，以及赔偿损失的范围。
• 若协议中无违约条款：则需要根据法律规定来确定赔偿责任。在这种情况下，违约方应赔偿因违约给对方造成的直接损失和可得利益损失，但不得超过违约方在订立合同时预见或应当预见到的因违约可能造成的损失。

二、协商与诉讼

• 协商：在发现违约行为后，守约方可以先与违约方进行协商，要求其继续履行合同或承担违约责任。协商是一种高效且成本较低的解决方式。
• 诉讼或仲裁：如果协商不成，守约方可以收集相关证据（如合作协议、沟通记录、损失凭证等），向法院提起诉讼或依据合作协议中的仲裁条款申请仲裁。在诉讼或仲裁过程中，守约方需要充分举证证明违约行为以及由此造成的损失，以便法院或仲裁机构能够作出公正的裁决。

三、赔偿范围与计算

• 直接损失：直接损失通常包括因违约行为导致的实际经济损耗，如为合作投入的资金、设备等。这些损失是可以直接计算并证明的。
• 间接损失：间接损失则包括因违约行为导致的预期利益损失。这种损失虽然不易直接计算，但可以通过合理的预测和估算来确定。在计算间接损失时，需要考虑合同履行后可能获得的利益以及违约行为对这些利益的影响。

四、注意事项

• 及时采取措施：在发现违约行为后，守约方应及时采取措施防止损失扩大。如果守约方未能采取合理措施导致损失扩大，那么扩大部分的损失可能无法要求赔偿。
• 保留证据：在协商、诉讼或仲裁过程中，守约方需要保留所有与违约行为相关的证据。这些证据将有助于证明违约行为以及由此造成的损失。

综上所述，当合作伙伴单方毁约时，赔偿的处理方式需要依据合作协议中的违约条款以及相关法律法规来确定。守约方应首先尝试与违约方进行协商，如果协商不成，则可以通过诉讼或仲裁来维护自身合法权益。在赔偿过程中，需要明确赔偿范围并合理计算损失，同时注意保留相关证据以便后续使用。