针对医院员工吃空饷的问题，处理方式通常涉及多个层面和步骤，以确保问题得到妥善解决并防止类似情况再次发生。以下是一个清晰、详细且有深度的解答：

一、确认吃空饷情况

首先，需要明确“吃空饷”的定义，即员工未实际履行工作职责，却仍然从单位领取薪资或津贴。在医院环境中，这可能表现为员工长期旷工、请假后未归、挂名不上班但领取工资等情况。

确认吃空饷情况通常需要通过以下步骤：

1. 核查员工出勤记录：检查员工的上班签到、请假记录等，确认其是否实际到岗工作。
2. 核对工资发放记录：与财务部门合作，核查员工的工资发放情况，确保薪资与出勤记录相符。
3. 实地调查：如有必要，可进行实地调查，了解员工是否确实在岗位上工作。

二、处理吃空饷员工

一旦确认存在吃空饷情况，医院应立即采取措施处理相关员工。处理方式可能包括：

1. 追回薪资：对于已经发放的薪资，应要求员工退还。如果员工拒绝退还，医院有权通过法律途径追讨。
2. 纪律处分：根据医院的规定和员工的违规程度，给予相应的纪律处分，如警告、记过、降职、开除等。
3. 法律责任：如果员工的行为构成违法，医院应依法向相关部门举报，追究其法律责任。

三、建立长效机制

为了防止吃空饷问题再次发生，医院需要建立长效机制，包括：

1. 完善管理制度：制定或完善员工出勤、请假、薪资发放等管理制度，确保制度严密、可操作性强。
2. 加强监督：设立专门的监督机构或人员，定期对员工的出勤和薪资发放情况进行检查，确保制度得到有效执行。
3. 加强教育：对员工进行法律法规和职业道德教育，提高员工的法律意识和职业操守。
4. 鼓励举报：建立举报机制，鼓励员工积极举报吃空饷等违规行为，对举报人给予保护和支持。

四、案例参考

以陕西咸阳为例，该地区对“吃空饷”问题进行了集中整治，通过自查、检查和整改三个阶段，清理出“吃空饷”人员并全部处理到位。这包括追回薪资、给予纪律处分等措施。同时，咸阳市还出台了相关实施方案，建立防治“吃空饷”问题的长效机制。

综上所述，处理医院员工吃空饷问题需要明确情况、及时处理并建立长效机制。通过完善管理制度、加强监督、加强教育和鼓励举报等措施，可以有效防止吃空饷问题的发生。