首先，我们需要明确一点：在建设工程合同中，甲乙双方的权利和义务是依据合同条款来确定的。针对你提出的问题，“小区开发施工方正负零错误，甲方能罚乙亏款吗？”我们可以从以下几个方面进行分析：

1. 合同条款的约定：

   • 如果合同中明确规定了施工方正负零错误的处罚措施，包括罚款或赔偿损失等，那么甲方有权按照合同条款对乙方进行处罚。这种处罚是合法的，因为它是基于双方自愿达成的合同条款。
   • 如果合同中没有明确规定正负零错误的处罚措施，那么甲方就不能直接对乙方进行罚款或要求乙方承担亏款。

2. 法律层面的规定：

   • 在没有合同条款支持的情况下，甲方不能单方面对乙方进行罚款。因为罚款是一种行政处罚或合同约定的违约责任形式，它必须基于法律或合同的明确规定。
   • 如果施工方的正负零错误导致了甲方的损失，甲方可以通过法律途径要求乙方承担赔偿责任。但这需要甲方提供充分的证据来证明损失的存在以及损失与乙方施工错误的因果关系。

3. 实际操作的建议：

   • 首先，双方应仔细审查合同条款，明确各自的权利和义务以及违约责任。
   • 如果合同中没有相关规定，而甲方确实因乙方的施工错误遭受了损失，甲方应收集相关证据（如施工记录、损失清单、鉴定报告等），并与乙方进行协商，寻求合理的解决方案。
   • 如果协商不成，甲方可以依法向法院提起诉讼，要求乙方承担赔偿责任。

综上所述，甲方能否对乙方进行罚款或要求乙方承担亏款，取决于合同条款的约定以及法律层面的规定。在没有明确条款支持的情况下，甲方不能单方面对乙方进行罚款。如果确实存在损失，甲方应通过法律途径来维护自己的权益。