工程项目中，即使甲乙双方都有责任，也并非一定要通过罚款来解决问题，合理处理的方式有多种。

1. 分析责任与罚款的关系：

   • 罚款通常作为一种对违约行为的制裁手段，在合同中明确约定。若双方合同中并未规定在双方都有责任时需通过罚款解决，则罚款并非必然选择。
   • 即便合同中有罚款条款，若双方责任相当，且罚款并非解决争议的最佳方式，也可考虑通过其他途径处理。

2. 合理处理方式：

   • 协商与调解：首先，双方应坐下来协商，明确各自的责任范围，并探讨如何通过修补、补偿或其他非罚款方式解决问题。
   • 修改合同条款：若原合同中关于罚款的条款不适用于当前情况，双方可协商修改合同条款，以更合理的方式处理未来可能出现的争议。
   • 第三方评估与仲裁：在协商无果的情况下，可邀请第三方专业机构对争议进行评估，或按照合同约定的仲裁条款申请仲裁，以公正、客观地解决争议。
   • 法律诉讼：若上述方式均无法解决问题，且争议涉及重大利益，双方可通过法律诉讼途径解决。

3. 法律依据与注意事项：

   • 根据《民法典》的相关规定，合同当事人应按照合同约定履行义务，但并未规定在双方都有责任时必须通过罚款解决。
   • 在处理争议时，双方应遵守法律法规，不得采取违法手段进行报复或制裁。
   • 我建议双方在签订合同时，就明确约定争议解决的方式和程序，以避免未来出现不必要的纠纷。

综上所述，工程项目中甲乙双方都有责任时，并非一定要罚款。双方应通过协商、调解、修改合同条款、第三方评估与仲裁或法律诉讼等合理方式处理争议。如有进一步需要，您可以继续咨询我。