当摩托车发生事故且双方责任各占一半时，赔偿的处理方式主要遵循以下原则：
一、人身损害赔偿
对于双方因事故导致的人身伤害，如医疗费、误工费、护理费以及伤残赔偿金等，首先由双方的保险公司在交强险的限额范围内进行赔偿。交强险是为了保障交通事故中受害人能够迅速获得赔偿而设立的一种强制性保险。
医疗费：包括治疗受伤所花费的所有费用，如住院费、手术费、药品费等。
误工费：因受伤不能工作而损失的收入，根据受害人的收入状况和误工时间来确定。
护理费：照顾受伤者所产生的费用，通常根据护理人员的收入状况和护理时间来计算。
伤残赔偿金：针对因伤导致残疾的情况，根据残疾等级和受害人的收入状况等因素来确定。
如果交强险的赔偿限额不足以覆盖双方的全部损失，那么超出的部分将按照责任比例（即各50%）来分担。
二、财产损失赔偿
对于因事故导致的财产损失，如车辆修理费等，同样先由保险公司在交强险的限额内进行赔偿。超出交强险限额的部分，也按照责任比例来分担。
三、理赔流程与证明材料
双方应积极配合保险公司进行理赔工作：提供必要的证明材料，如病历、发票、医疗凭证、误工证明等。这些材料是保险公司进行赔偿的重要依据。
协商与诉讼：如果双方无法通过协商达成一致意见，可以通过诉讼的途径来解决纠纷。法院将根据具体的情况和证据来做出公正的判决。
综上所述，当摩托车发生事故且双方责任各占一半时，赔偿的处理方式主要是依据交强险的赔偿限额进行先行赔付，超出部分按照责任比例来分担。双方应积极配合保险公司进行理赔工作，并提供必要的证明材料。如果协商不成，可以通过诉讼途径来解决纠纷。