扰乱单位秩序罪的刑事立案标准，主要依据行为的表现、情节的严重程度以及造成的后果来判定。以下是对此罪的立案标准进行的详细阐述：

首先，从行为表现来看，若行为人多次（通常指三次及以上）实施扰乱单位秩序的行为，并且在经过行政处罚后仍然继续实施此类行为，这往往就符合了立案的标准。这里的“单位”是一个广义的概念，包括了各类机关、团体、企业以及事业单位等。

其次，从情节的严重程度和造成的后果来看，若行为人的扰乱行为导致单位的工作、生产、营业、医疗、教学或科研等活动无法正常进行，并且因此造成了重大的经济损失（具体数额可能因地区而异，由当地司法机关根据实际情况进行认定），这也将构成立案的重要依据。此外，如果在扰乱单位秩序的过程中，行为人使用了暴力、威胁手段，或者进行了打砸抢等恶劣行为，造成了恶劣的社会影响，如导致单位工作人员受伤或者在社会上引发了广泛的负面舆论等，这些情形也通常会被认定为达到了刑事立案的标准。

需要注意的是，由于不同地区的实际情况和法律环境可能有所不同，因此在遵循基本法律框架的前提下，各地区可能会根据当地的实际情况对立案标准进行适当的调整。因此，在具体案件中，还需要结合当地的法律规定和司法实践来判断是否达到了立案的标准。

综上所述，扰乱单位秩序罪的刑事立案标准是一个综合考量行为表现、情节严重程度和造成后果的复杂过程。如果行为人的行为符合上述情形之一或多项，那么公安机关通常会进行立案侦查，并由司法机关依据刑法及相关法律法规进行后续的处理。