合作保密协议不仅仅是对公司员工的，它也适用于与公司有往来的外部人员。具体来说：
公司内部员工：保密协议通常适用于公司内部各级管理人员、技术研发人员、市场营销人员、财务人员等，这些员工在日常工作中会接触到公司的各类机密信息。通过签署保密协议，可以明确他们的保密责任和义务，防止未经授权的披露、使用或泄露公司的商业秘密。
公司外部人员：保密协议同样适用于因业务合作、项目参与等关系与公司有往来的外部人员，如供应商、合作伙伴、顾问、承包商等。这些外部人员在与公司开展业务过程中，可能会获取到公司的保密信息。因此，与他们签署保密协议也是必要的，以确保公司的商业秘密得到妥善保护。
综上所述，合作保密协议是对公司员工以及与公司有业务往来的外部人员的一种约束和保护措施，旨在维护公司的合法权益和商业竞争优势。如果你在这方面有任何疑问或需要进一步的法律建议，请随时向我咨询。