合同一式两份都在原告处，合同依然有效。合同的效力并不取决于其被哪一方持有或持有的份数，而是取决于合同是否满足法律规定的生效要件。以下是对这一问题的详细分析：

1. 合同生效的要件：

   • 当事人适格：即合同双方都具有签订该合同的法律资格。
   • 意思表示真实：合同双方都是出于真实意愿而签订合同的，没有受到欺诈、胁迫等不正当手段的影响。
   • 内容合法：合同的内容不违反法律、行政法规的强制性规定，不违背公序良俗。

2. 持有份数与合同效力的关系：

   • 合同一式两份是为了方便双方各自保管和查阅，但并不是合同生效的必要条件。
   • 即使合同只有一份且被原告持有，只要合同满足上述生效要件，它仍然是有效的。

3. 法律后果：

   • 持有合同的一方可依据合同主张权利、履行义务。
   • 若对方否认合同效力，需有充分证据证明合同存在法定无效或可撤销情形，如欺诈、胁迫、重大误解、显失公平等。

4. 实践建议：

   • 在签订合同时，最好确保双方各持有一份，以避免因合同丢失或损毁而带来的不必要的麻烦。
   • 如果因只有一方持有合同而引发纠纷，未持有合同的一方应尽可能收集其他证据来证明合同关系的存在及内容，如证人证言、书面通知、电子邮件等。

综上所述，合同一式两份都在原告处并不影响合同的效力。只要合同满足法律规定的生效要件，它就是有效的。在实践中，双方应尽可能各持有一份合同，并妥善保管，以避免不必要的纠纷。