关于建设工程设备租赁合同中的违约金计算问题，这确实是一个涉及合同约定、法律规定以及司法实践的综合性问题。以下是对此问题的详细解答：
一、违约金的确定方式
合同约定：
- 在签订建设工程设备租赁合同时，双方可以明确约定违约金的具体数额或计算方式。
- 具体数额可以是一个固定的金额，例如“逾期支付租金，需支付X元违约金”。
- 计算方式则可以是按未支付租金金额的每日一定比例（如万分之五）或租金总额的一定比例（如10%）来计算。
法律规定：
- 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，违约方应赔偿因违约给对方造成的实际损失，包括合同履行后可以获得的利益，但不得超过违约时预见到的损失。
- 在合同未约定或约定不明时，法院可能会参照逾期罚息利率标准（如LPR加计30%-50%）来计算违约金。
二、司法实践中的考量因素
在司法实践中，法院或仲裁机构在确定违约金数额时，会综合考虑以下因素：
- 违约行为的性质与严重程度：恶意拖欠且经多次催告仍不支付的，可能会支持较高的违约金；因不可抗力等特殊原因短暂逾期的，可能会酌情降低违约金。
- 实际损失：法院会考虑违约给守约方带来的直接和间接损失，损失较大的，可能会提高违约金数额。
- 合同履行情况：如果合同大部分已履行且只是短暂违约，可能会降低违约金；如果违约导致合同无法继续履行，可能会支持较高的违约金。
三、违约金的调整
- 增加请求：如果约定的违约金低于实际损失，受损方可以请求法院或仲裁机构增加违约金。
- 减少请求：如果约定的违约金过高，违约方可以请求法院或仲裁机构适当减少违约金。在调整时，会综合考虑实际损失、合同履行情况、过错程度以及预期利益等因素。
四、注意事项
- 合理性：双方在约定违约金时，应确保违约金数额或计算方式的合理性，避免过高或过低的违约金导致不公平的结果。
- 法律依据：在发生违约时，双方应依据合同约定和法律规定来处理纠纷，维护自身的合法权益。
综上所述，建设工程设备租赁合同中的违约金计算是一个复杂的问题，需要综合考虑合同约定、法律规定以及司法实践中的多种因素。因此，在签订合同时，双方应充分协商并明确约定违约金的相关条款，以确保合同的合法性和有效性。在发生违约时，也应根据具体情况来合理确定违约金的数额或计算方式。