“旷工一天扣三天工资”的做法在大多数情况下是不合法的。这一结论主要基于以下几点分析：
法律依据：
- 根据《中华人民共和国劳动法》第五十条，工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人，不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。这一规定构成了判断扣罚工资行为合法性的基本法律框架。
- 同时，《中华人民共和国劳动合同法》第三十条也规定，用人单位应当按照劳动合同约定和国家规定，向劳动者及时足额支付劳动报酬。
旷工工资扣除情况：
- 通常情况下，旷工一天，用人单位可以不支付当天的工资，这是基于劳动者未提供相应劳动的合理对应措施。
- 但直接扣除三天工资，则涉嫌克扣其他正常工作日的工资，这违反了劳动法的规定。
企业规章制度的合法性：
- 虽然企业有权根据自身情况制定管理制度或劳动合同来约定旷工的处理办法，但这些规定必须合法、合理，且不违反劳动法的原则和精神。
- 如果企业的规章制度或劳动合同中明确规定了旷工一天将扣3天工资，并且这一规定未经过合法的程序制定或公示，或者内容显失公平，那么这一规定本身就是不合法的。
经济损失的赔偿：
- 如果劳动者旷工给用人单位造成了经济损失，用人单位可以按照劳动合同的约定要求其赔偿经济损失。
- 但赔偿的扣除部分不得超过劳动者当月工资的20%，且扣除后的剩余工资部分不得低于当地月最低工资标准。
综上所述，“旷工一天扣三天工资”的做法在法律上通常是不合法的，因为它可能侵犯了劳动者的报酬权。企业在制定和执行相关规定时，应谨慎考虑各方面因素，确保规定的公平、公正和合理；员工也应自觉遵守规定，共同维护和谐的劳动关系。如果你在这方面遇到了问题，可以直接向我咨询，我会为你提供进一步的法律帮助。