行政赔偿案二审时是可以进行调解的。

在行政赔偿案件中，调解是一种重要的解决纠纷的方式。根据《行政诉讼法》的相关规定，人民法院审理行政案件，一般不适用调解。但是，对于行政赔偿、补偿以及行政机关行使法律、法规规定的自由裁量权的案件，是可以进行调解的。调解应当遵循自愿、合法原则，不得损害国家利益、社会公共利益和他人合法权益。

在行政赔偿案的二审过程中，如果双方当事人愿意，人民法院可以组织进行调解。通过调解，赔偿请求人和赔偿义务机关可以协商放弃、变更赔偿要求，确定赔偿数额等，从而达成赔偿协议。这种方式有助于化解矛盾，提高解决纠纷的效率。

因此，如果你在行政赔偿案的二审过程中，有意愿进行调解，可以向人民法院提出申请，由法院组织双方当事人进行调解。当然，如果调解不成，当事人仍然可以坚持自己的诉求，要求法院依法作出判决。