网上业务专用章，即电子业务专用章，是有效的。其有效性主要基于以下几点：

一、电子印章的合法性

根据《中华人民共和国电子签名法》的相关规定，可靠的电子签名与手写签名或者盖章具有同等的法律效力。而电子印章，作为电子签名的一种表现形式，只要其符合法律对于可靠电子签名的要求，即被视为具有法律效力。这意味着，在符合法律规定的情况下，电子业务专用章与实体业务专用章具有同等的法律效力。

二、电子印章的可靠性

电子印章的安全性是其被广泛应用和认可的基础。电子印章通常基于可信密码技术生成身份标识，并通过数字证书确保印章的唯一性和防伪特性。数字签名技术则用来保护敏感信息的传输，保证信息的安全性。这些技术手段确保了电子印章在使用过程中的真实性和完整性，从而保障了其可靠性。

三、电子印章的普及与应用

随着数字化程度的加深，电子印章在政务服务和企业活动中的应用愈发频繁。例如，在证照、公文、合同、发票等业务中，电子印章已经得到了广泛应用。这不仅提高了政府行政效能和企业、群众办事的便捷性，还有利于在各类事项中快速认证，节约办事成本。同时，基于电子印章数据库加密、认证的智能化核验，可以保证全程留痕，使整个流程更规范和安全。

四、电子印章的管理与规范

为了规范电子印章的管理和使用，各地政府也相继出台了相关管理办法。例如，广东省政府就发布了《广东省电子印章管理暂行办法》，明确鼓励更多地使用电子印章，并规范其管理。这些管理办法的出台，进一步保障了电子印章的合法性和有效性。

综上所述，网上业务专用章（电子业务专用章）是有效的，并且随着技术的发展和政策的完善，其应用将会更加广泛和深入。在使用电子业务专用章时，建议遵循相关法律法规和管理办法的要求，确保其合法性和有效性。