农民工保证金主要以以下几种形式存在：

1. 工资保证金专用账户：

   • 这是在银行设立的专门用于存储农民工工资保证金的账户。施工总承包单位需要按照规定的比例将资金存入此账户，以确保农民工工资的支付。

2. 银行保函：

   • 银行保函是银行类金融机构出具的一种书面担保凭证，用于替代施工总承包单位以现金方式存储的工资保证金。保函应以工程所在地人力资源社会保障行政部门为受益人，且通常为不可撤销、见索即付的性质。

3. 保险公司保证保险：

   • 保险公司提供的保证保险产品也可以作为农民工工资保证金的替代方式。这种保险产品需要由经保险监管部门批准可以从事保证保险业务的保险公司提供，并且保险条款需要经过金融监督管理部门的批准或备案。

4. 工程担保公司保函（在部分地区可实施）：

   • 在有条件的地区，工程担保公司出具的保函也可以被接受作为农民工工资保证金的替代。这要求工程担保公司必须经有关部门批准注册，并且以工程担保为主要经营范围和主要经营业务。

综上所述，农民工保证金可以以现金存储于专用账户的形式存在，也可以通过银行保函、保险公司保证保险或工程担保公司保函等金融产品来替代。具体采用哪种形式，通常取决于地方政策规定以及施工总承包单位的具体情况和选择。