离职补偿金是否包含已经发放的工资中的年终奖部分，需根据具体情况来判断。以下是详细分析：
一般情况：
- 离职补偿金通常按照劳动合同解除或终止前十二个月的平均工资来计算。
- 年终奖若作为工资的一部分，且在过去十二个月内已经发放，理论上应当分摊到相应月份计入平均工资，从而纳入离职补偿金的计算。
特殊情况：
- 若年终奖并非固定发放，而是依据公司经营状况、员工表现等因素决定，且其发放具有较大的灵活性和不确定性，那么在具体计算离职补偿金时，可能会根据实际情况进行合理调整，不一定完全纳入计算。
- 若劳动合同或公司规章制度中有特别约定，且该约定不违反法律法规的强制性规定，则应按照约定来确定年终奖是否纳入离职补偿金的计算。
举例说明
- 假设某员工在过去十二个月内每月工资为5000元，且年终奖为12000元，分摊到每月为1000元。那么，在计算离职补偿金时，其月工资标准应为5000元+1000元=6000元。
- 若该员工的年终奖并非固定发放，且公司能够证明其发放与员工的离职前十二个月工作关联性不大，那么在具体计算离职补偿金时，可能会根据实际情况进行调整，不将年终奖完全纳入计算。
法律依据
- 《中华人民共和国劳动合同法》第四十七条：经济补偿按劳动者在本单位工作的年限，以每满一年支付一个月工资的标准向劳动者支付。其中，月工资是指劳动者在劳动合同解除或者终止前十二个月的平均工资。
- 《关于工资总额组成的规定》第四条及第七条：工资总额包括奖金，而年终奖属于奖金的一种，性质上属于工资的一部分。
结论与建议
离职补偿金是否包含年终奖部分，需根据劳动合同、公司规定以及年终奖的发放性质来综合判断。若存在争议，建议双方协商解决；若协商不成，可依法向劳动争议仲裁委员会申请仲裁或向人民法院提起诉讼。在签订劳动合同时，建议明确年终奖的发放规则和其在离职补偿中的计算方式，以避免后续纠纷。