政府对企业补贴专利费不一定违反公平竞争审查条例。具体分析如下：

一. 公平竞争审查的基本原则

1. 目的与原则：公平竞争审查的目的是为了规范和约束政府行为，防止政府出台排除、限制竞争的政策措施，从而维护市场的公平竞争环境。其原则包括市场准入和退出标准、商品和要素自由流动标准、影响生产经营成本标准以及影响生产经营行为标准等。

二. 政府补贴专利费的分析

1. 补贴性质：政府对企业补贴专利费，本质上是一种政府补助或财政支持，旨在鼓励企业创新、保护知识产权。
2. 是否违反公平竞争：关键在于补贴的方式、范围和条件是否构成了对特定企业的偏袒，从而排除了其他企业的公平竞争机会。
   • 如果补贴是普遍性的，即所有符合条件的企业都能获得，且补贴标准透明、公正，那么这种补贴通常不会违反公平竞争审查条例。
   • 如果补贴是针对性的，仅对特定企业或行业进行，或者补贴条件设置不合理，导致其他企业无法享受，那么这种补贴就可能构成对公平竞争的限制或排除，从而违反公平竞争审查条例。

三. 结论与建议

1. 结论：因此，政府对企业补贴专利费本身并不直接违反公平竞争审查条例，关键在于补贴的具体实施方式和条件。
2. 建议：政府在制定补贴政策时，应确保补贴的普遍性、透明性和公正性，避免对特定企业或行业进行偏袒，从而维护市场的公平竞争环境。同时，企业也应关注政府补贴政策的变化，合理利用政府补贴资源，促进自身的创新和发展。

综上所述，政府对企业补贴专利费是否违反公平竞争审查条例，取决于补贴的具体实施方式和条件。如有进一步需要，您可以继续咨询我。